首先在燃料上區分，將生物質能源作為燃料的鍋爐稱之為生物質鍋爐。將生物質鍋爐同燃煤鍋爐的顆粒排放進行對比,對2個結構不同的鍋爐進行試驗分析,生物質鍋爐采用的是秸稈和木質。而將煤、碳作為燃料的鍋爐稱之為燃煤鍋爐。在鍋爐治理環保的多項政策下，傳統的燃煤鍋爐徹底退出了舞臺，僅要求10噸以上鍋爐除塵方面需達到國家環保要求，(灰塵、硫、硝的排放)。

　　從結構上看，生物質鍋爐燃料因其熱值較低，上料比煤炭量大，爐膛設計比燃煤鍋爐大，爐拱高，一般配置二次鼓風，這樣，生物質顆粒燃料才能充分燃燒，獲得更高的熱值，提高熱效率。

　　從使用燃料上說，生物質鍋爐既能燃燒生物質燃料，又能適應煤炭，而燃煤鍋爐僅僅燒煤炭而已。